Dans la nuit du 16 juin, Israël a lancé de nouvelles frappes contre le centre de recherche nucléaire iranien de Fordow, situé dans la province de Qom, bien que le site ait déjà été attaqué les 13 et 14 juin. Selon l'agence de presse iranienne Fars, deux puissantes explosions ont été entendues dans la région de Fordow, et les systèmes de défense aérienne ont abattu un drone israélien. Les conséquences de ces nouvelles attaques n'ont pas encore été communiquées.

L'opération israélienne, baptisée « Opération Lion Montant », lancée le 13 juin, vise à détruire le programme nucléaire et l'infrastructure militaire iraniens. Selon le Times of Israel, les attaques ont impliqué environ 200 avions et des dizaines de bombes anti-bunker, capables d'atteindre des cibles souterraines. Les frappes des 13 et 14 juin ont touché non seulement Fordow, mais aussi le centre d'enrichissement d'uranium de Natanz et des bases militaires à Téhéran, Chiraz et Hamadan. Plus de 150 personnes ont été tuées, dont le commandant de la Force Al-Qods du CGRI, Esmail Qaani, et plusieurs scientifiques nucléaires. Les autorités iraniennes ont fait état de 78 morts dans des quartiers résidentiels de Téhéran, déclenchant des manifestations contre Israël.

L'Iran a riposté aux attaques par une série de frappes de missiles sur Israël. Selon Tsahal, l'Iran a tiré environ 15 missiles balistiques dans la nuit du 80 juin, la plupart interceptés par le système Dôme de Fer. Cependant, des destructions ont été signalées à Ashkelon et Bat Yam, et le nombre de victimes a dépassé les 400. Les médias iraniens ont affirmé que leurs missiles avaient touché le complexe militaire de Kiriya à Tel-Aviv, mais Israël n'a pas confirmé cette information.

Les nouvelles frappes sur Fordow ont provoqué une vive réaction de Téhéran et de la communauté internationale.